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如今看来，肖普夫被彻底击垮了。
面对这样的攻击，很少有人能够一笑置之，肖普夫当然开始反击，他搜集了更多资料来证明自己的论点。
2002年4月，在美国国家航天局春季学术会议上，这两人有过一次激烈的交锋，两人都固守自己的立场。
布莱瑟这个傲慢十足的牛津先生，指责肖普夫的样品“就是简单的海底热泉现象，恐怕只有热却没有光”
。
然而，大部分人都没被任何一方说服。
虽然大家对于最初微体化石的生物性质仍然存疑，但对于其他晚了数亿年的微体化石并没有多少争议。
而布莱瑟本人也发现了较晚年代的化石标本。
现在大部分的科学家，包括肖普夫，都开始采取更严格的标准来检查生物起源的证据。
至此，整个事件唯一的受害者，只有那些蓝细菌，它们过去曾是肖普夫的徽章，但现在肖普夫也已经让步，承认那些微体化石可能不是蓝细菌，至少不比其他鞭毛细菌化石更像蓝细菌。
所以我们又回到了原点，绕了一大圈，仍然对蓝细菌的起源毫无头绪。
在过去这二三十年间，科学家在新技术的加持下，用各种名称让人生畏的方法，详细分析了细菌和植物光合作用系统的分子结构。
这些方法的原理也如它们的名称一样让人生畏，比如X射线晶体学，或者电子自旋共振光谱成像。
不过我们不必理会它们的原理，只要知道科学家用这些方法，几乎从原子等级上（但却总是恼人地还差一点）分析了光合作用复合物的详细构造与形状。
现在会议中仍会发生争论，不过争论的主要是细节部分。
在我写本书之时，刚参加完一场英国皇家学会会议。
在那场会议里，科学家在争辩“放氧复合体中五个原子的正确位置”
，既可说是寻幽入微也可说是吹毛求疵。
说是它寻幽入微，是因为这五个原子的精确位置，关系到它们分解水分子的化学机制，而这正是解决世界能源问题的关键；说是它吹毛求疵则是因为，这些口角不过就是如何在几个原子半径内把五个原子排好，争论的差异也就在数个埃（百万分之一毫米）之间。
老一辈的科学家或许会非常惊讶，现在科学家对于光系统Ⅱ中其他46，630个原子的位置倒是没有太多争议。
这些原子的位置由英国伦敦帝国理工学院的生化学家吉姆·巴伯（JimBarber）的团队测定，近来精准度还在不断提升。
虽然还剩几个原子没找到自己的位置，不过我们研究光系统的结构已经10多年了，如今已大致明朗，可以给我们讲述它的进化故事了。
2006年生化学家鲍勃·布兰肯希（BobBlankenship，现在是美国华盛顿大学圣路易分校的教授）所领导的团队指出，在各种细菌体内，两种光系统[7]的构造几乎都一样。
尽管不同群的细菌在进化上的距离如此遥远，但是它们光系统的核心构造却如此相似，相似到可以在计算机构图上完全重叠。
不仅如此，布兰肯希证实了另外一件科学家思考许久的事情，那就是光系统Ⅰ和光系统Ⅱ的核心构造也一样，而且几乎可以确定它们应该是在很久很久以前，由同一个祖先进化出来的。
换句话说，故事应该就是很久很久以前，本来只有一个光系统，有一天它的基因变成了两份，结果一次制造了两个一模一样的光系统。
随着时间变迁，在自然选择的影响下，两个光系统开始产生分异，但仍持有一样的核心构造。
最后，两个光系统靠着Z型反应连接在一起，并经由叶绿体传给了植物和藻类。
不过这个简化版的故事，掩盖了整个现象背后的难题。
复制出两个原始的光系统并不能解决产氧光合作用的问题——一个强推电子者和一个强拉电子者，永远不可能自己结合在一起。
在光合作用能运作之前，两个光系统必须先往相反的方向进化，一个推一个拉，唯有如此，当它们连接在一起时才会有用。
所以问题就是，什么样的事件会造成两个光系统先走上岔路，之后再被连接在一起，如同既亲密又对立的欢喜冤家，或像男人与女人一样，先分开之后又结合成一个受精卵？
光系统Ⅰ在细菌体内做的事和在植物体内一模一样。
它们会从无机物中拉走电子，变身成为分子版“街头混混”
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