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这两者的关系，不是一个那样简单的问题，应当静心平气，公正审察，不可狃于成见，盲从附和。
[15]
不仅如此，谢扶雅还试图建立一门接纳科学方法的宗教科学，把它看作宗教适应现代科学发展的需要。
正如他所说：“老实说，现代开明的宗教，不但容纳今日科学各种定理而且应用科学方法以研究宗教现象，评量宗教事实，阐明宗教的意义及价值，所谓科学方法，即第一，观察与实验，第二试设假定，第三更用别种观察及实验以试此假定之成立与否而证实之或修改之，以准备更进一步的实验。
这样便能渐渐组成科学公律，以阐明宗教的真相。
数千年来各民族的宗教意识，宗教信念和宗教行为，都已展列在宗教学者的实验室中，运用史学的眼光，心理学的公律，社会学的方法，加以整理，分析，比较而获得正确的了解，宗教科学（ReligiousSces）快将步社会科学的后尘而构成严正的科学了。”
[16]谢氏的这一观点，显然来源于18世纪英国宗教学者马克思·缪勒所开创的宗教学（TheSceions），用宗教学来批驳科学论者对宗教的反对，显然是缺乏说服力的。
不过，谢扶雅的宗教观也正如他自己在上面所说的，是非常现代的。
因为他并不认为要拘泥于已有的宗教理解，而应当使宗教吸取更多现代科学成分，以使宗教（基督教）更加充实起来。
他说：
科学界许多新发见，不但无碍于宗教信仰，反供给宗教无数新资料，使它的内容更加充实。
新天文学所启示的天空恒河沙数星球，新生物学所提供的人类数亿万年历史，皆足使人开拓宗教的胸怀，广远宗教的眼界，新物理学所发见的相对和有机的原理，新心理学所提出的整全和心物融合的学说，皆足使人惊叹宇宙是一个何等系统分明秩序井然的总体。
上帝的观念，在未有科学之先，雷公、电母、蛇蜴图腾——你想，何等丑辱！
现代科学阐明了自然的真际，估定了社会的价值，将上帝观纯化作人类所憧憬企求着的真和善和美——这是何等的高升和跃进。
[17]
谢扶雅的上述现代宗教观念，颇类似于陈独秀在五四时期所追求的“新宗教”
。
与吴雷川一样，谢扶雅并不认为宗教（基督教）与科学之间是对立或冲突的关系，关键是我们要改变基督教如何适应科学的方式。
按照他的理解，正是有了现代新科学，从而破除了种种迷信，从而才有了新宗教的可能。
这是科学对宗教的大贡献。
但是，谢扶雅并非一味地强调宗教必须适应科学的发展，同样，他也强调科学应当与宗教合作，防止科学的乱用。
他说：
反过来也可以说一句：有真宗教才有真科学。
宗教对事物的态度总是和谐的，全局的。
反之，科学的态度常是敌视的，分析的。
这是科学的长处，但也可以说是短处。
……科学家因效忠真理，献终身于研究之神坛，甚或为真理而致牺牲其性命，这显然是宗教精神的功用。
所以宗教对于科学至少也算可告无罪吧！
科学本身是中立性的，严格说来，科学无所谓价值，它虽有力，但好比是火，用之于善，可除黑暗；用之于不善，可兆焚如。
科学若加上宗教的指使，才真能为人类造福，医药学须济以仁心仁术而后病家可速复健康，农艺学之于田圃，遗传学之于优生，皆表示科学与宗教合作后的效用。
反之，倘用化学于绿气炮以助战，用电学于各种凶器以杀人，皆证明科学与宗教分离后的罪恶。
这样看来，科学不过是工具，而宗教乃是主使者，科学不过是机械，而宗教乃是真智慧。
科学本身无光，须赖宗教之日光以为光。
这不又是宗教对科学的大贡献吗？[18]
这也就是说，科学与宗教都是处于变化发展之中，二者之间并不存在根本性的矛盾与冲突，而是相互影响、相辅相成。
科学的发展带动宗教的进化，而宗教的进化促使科学更好地发展。
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