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由于资金短缺、设备简陋，民办学校刚开始创办时规模往往都很小，再加上开始时民办高校主要聘请的是离退休教师，缺乏专职教师，更没有学科带头人。
因此，办学层次普遍偏低，大多限于专科层次。
经过近30年的发展，不少民办高校积聚了人力资源，开始举办本科专业，但至今仍为数不多。
297所独立设置的民办高校中有本科学历的只有45所，占所有独立设置的民办高校的15%。
大学举办的独立学院因为有大学的专业支持，并且得到贷款支持，因此，无论在校舍设备上还是在师资水平上都比较占优势，所以办学的起点也高，一般一开始就举办本科专业。
不过从总体上看，中国的民办高校还是低重心、低层次的，至今还没有一所学校有权授予研究生层次的学位。
第五，民办学校的产权不甚明晰，办学性质不够明确。
《民办教育促进法》第35条规定：“民办学校对举办者投入民办学校的资产、国有资产、受赠的财产以及办学积累，享有法人财产权。”
第36条规定：“民办学校存续期间，所有资产由民办学校依法管理和使用，任何组织和个人不得侵占。”
但上述条款都没有明确规定学校的产权性质，这就影响到投资者的继续投入。
《民办教育促进法》第3条规定：“民办教育事业属于公益性事业。”
第51条规定：“民办学校在扣除办学成本、预留发展基金以及按照国家有关规定提取其他的必需的费用后，出资人可以从办学结余中取得合理回报。”
这些规定都没有明确投资办学者的权益。
中国的民办教育不像国外私立学校主要依靠基金会、教会和捐赠，而是要由创办者自筹资金。
投资创办者往往是私人企业家，而私人企业总有寻利动机。
法律规定民办教育事业属于公益性事业，也就是说不能营利，这就与企业寻利动机之间产生了矛盾，企业缺乏进一步投入的动力，进而导致民办高等教育缺乏可持续发展的资金支撑。
以上特征制约着中国民办高等教育的发展。
要改变不利状况，实现民办高等教育的持续健康发展，需要在思想观念和制度政策上有所转变，也需要民办高等学校自身的努力建设。
第一，要进一步解放思想，支持民办教育发展。
如果说，允许民办教育存在是第一次思想解放，突破了教育事业只能公办的框框，那么，现在则需要第二次思想解放，也就是说要对民办、公办一视同仁，对民办教育不仅要给予政策上的支持，而且要给予财政上的支持，特别是在学校发生困难的时候要积极扶植，使其继续发展。
《民办教育促进法》的颁布本应达到促进民办教育发展的目的，但实际状况是这几年民办学校发展越来越艰难。
造成这一状况的原因是多方面的，有民办学校的外部环境问题，也有民办学校自身的问题。
但政府对民办学校的认识不到位、支持不力也是其中一个重要因素。
把民办教育看作私营产业还是公益事业，是对民办教育的思想认识问题。
这个问题不解决，民办教育便难以得到发展。
如果将民办教育看作私营产业，政府可以不管，让其在市场上自由发展；如果将其看作公益事业，政府就应该支持。
但不少地方政府仍抱着前一种认识，认为民办学校就是私营的。
在不少人看来，虽然《民办教育促进法》规定民办学校不以营利为目的，但并不排除合理回报。
而既然可以有回报，但政府不仅不在财政上给予支持，还要收税，这就给民办学校发展造成很大困难。
其实，民办教育虽然是民间投资，但办的仍然是公益事业。
教育是培养人才的事业，不管谁投资，培养出来的人才都是全社会受益的，所以它应该是公益事业而不是私营产业。
我国民办学校不像国外私立学校大多由基金会或教会举办，不求回报，我国大多数民办学校由私人投资，总企求有所回报，但只要在合理范围内就应该支持，因为它总是在为社会培养人才。
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