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他肯定科学的专门化在人类文明发展上的必要性，但认为科学越是朝专门化方向发展，各个个人的知识可能会变得更加狭窄。
如果他们对这种狭窄性的弊端认识不足，甚至反而把它看作是进步的标志，那就会使他们对具有普遍性和本质意义的东西、对存在的本性和存在物之间的内在联系的研究和理解缺乏兴趣。
他说：“文明的思想发展所必要的专门化在上一世纪对于学者的哲学见解、从而对于促进学术工作的机构的发展，发生了最为不幸的影响。
大学中各个系都自此强调各自的独立性。
一个大学所获得的声望，也与它的这种专门化的扩大成正比。”
“随着科学的发展，人们理解的宽度变窄了。
19世纪是一个取得了伟大成就的时期，这些成就可谓数不胜数。
但它未能产生对于各种各样的兴趣、各种各样的潜在的东西都有敏锐的认识的学者。
它在应当力求理解的地方却作了批判和推翻的工作……为了理解存在的本性，我们必须把握一种深度的本质特征，这种深度超出一切错误的细节，它是这一时代可以识别的生活的上升的主要原因。”
[9]怀特海后面这段话的主要意思正是批评19世纪的学者们在需要理论思维的地方忽视了理论思维，未能理解当时大量的科学成就中的“潜在的东西”
，即超越一切错误细节的存在的本性，或者说，未能从理论的高度去总结和概括具体的、多种多样的科学成就。
怀特海作为一个科学哲学家的杰出之处，在于他既肯定科学的专门化所取得的各种重要成就，又要求把握这些专门化的研究及其成就的“深度的本质特征”
，揭示它们的“潜在”
意义，特别是其方法论意义。
怀特海认为，19世纪的科学研究超出以往抽象和理想化研究的范围而致力于分门别类的研究，特别是把确立抽象的科学概念与探究具体的技术和发明结合起来，是科学史上的重大进步，它彻底改变了人类生活条件。
怀特海谈道，19世纪不同于以往的独特和新颖之处是对工程技术的关注。
但这不只是采用了几个孤立的大发明，而是关注获得这些发明的方法。
“19世纪最大的发明就是找到了发明的方法。
一种新方法进入人类生活中来了。
如果要理解我们这个时代，有许多变化的细节，如铁路、电报、无线电、纺织机、综合染料等等，都可以不必谈，我们的注意力必须集中在方法本身。
这才是震撼古老文明基础的真正的新鲜事物……在科学概念与发明中间隔着一个绞尽脑汁的构思设计阶段。
新方法中有一个因素便是设法把科学概念与最后成果之间的鸿沟填起来。
这是有组织有步骤地向一个又一个的困难进攻的过程。”
[10]
怀特海对19世纪科学发展状况的描绘在一定程度上揭示了这一时期西方科学发展中开始凸显的用科学技术和科学方法来促进人的现实生活和实践的倾向，科学理论和实际相结合的倾向。
科学已不仅仅看作是一些抽象的理论和概念，而已发展到抱着实践的目的来对作为人类生活对象的各个领域（包括自然和社会、物质和精神等的广泛领域）进行分门别类的专门化的研究。
科学的功能已不只是理论上的满足，而首先是要促进工程技术等的发展，也就是促进社会生产力的发展。
从这种意义上可以说，与以往历史时代相比，19世纪已是真正科学的世纪。
19世纪英国学者梅尔茨谈道，“本世纪可以恰当地称为科学的世纪，就像上世纪称为哲学的世纪，或者16世纪称为宗教改革的世纪，15世纪称为文艺复兴的世纪”
[11]。
2.19世纪自然科学的新变更与形而上学自然观的危机
但是，19世纪同时又是自然科学处于危机的世纪。
这是因为以往被奉为经典的一系列科学原理为科学发展中的新概念和新理论所动摇和取代，或者说当时自然科学的一系列新发现否定了17—18世纪发展起来的形而上学自然观。
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