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他使进化的思想超越特定的领域，肯定整个宇宙都是进化的产物。
即使是那些特别稳定、可以称之为自然规律的自然习惯本身也是进化的，可以而且应当成为探索的对象。
皮尔士在科学方法上之强调进步和进化，使他必然反对把科学探索的成果以及这种探索方法凝固化和绝对化，这突出地表现在他由此提出的可错论（fallibilism）上。
这一理论认为，用科学方法所得出的任何结论、信念都可能发生错误而被推翻，都处于不断修正和发展的过程中。
那些已确立了的真理只能在某种程度上可以被认为是真理，它们的提出必然受到特定的时间和条件的限制，需要随着所处时间和条件的改变而加以改变。
任何一种可以称为真理的假设都需要改进；任何信念的确定性都相对于其证据，随着新的证据的发现而需要修正。
任何经验的陈述都不是绝对可靠的最后证实，甚至逻辑和数学的研究也并不排除错误的可能性。
皮尔士指出：“存在着三种我们所绝对不能达到的事物……即绝对的确定性、绝对的精确性、绝对的普遍性。”
（1.141）皮尔士由此反对科学研究中的故步自封，要求“不要阻塞探索的道路”
。
他反对崇拜权威，主张自由讨论和自由研究，以便取得科学研究的不断进步。
这使他的可错论与认识论上的悲观主义和怀疑主义毫不相干。
他明确指出，任何具有现实意义的问题在原则上都是可以得到解答的。
至少不能说它们不能回答。
他对于某些形态的独断论和怀疑论还做了种种批判，认为它们是科学探索的主要障碍（5.416）。
但是皮尔士在否定绝对确定性、绝对精确性和绝对普遍性时往往走向了另一个极端。
他由以往独断论把必然性绝对化、排斥偶然性而走向否定必然性，只承认偶然性。
他说：“如果你试图证实任何自然规律，那你就会发现，你的观察越是精确，它们就肯定会表明不正常地偏离了规律……如果尽可能向后追溯它们的原因，你就会不得不承认，它们总是出于任意决定或偶然性。”
（6.45）“如果你更深刻地反省，你就会看到，偶然性是我们未知的东西的原因的唯一名称。”
（6.54）皮尔士不懂得，或者说没有去思考相对与绝对、偶然与必然的辩证关系。
他由当时科学发展（特别是他所熟悉的概率论和统计规律）证明了相对性和偶然性的普遍存在，证明了科学结论和信念的暂时性和可错性，把一切都当作纯粹相对的、偶然的东西，而这可能导致他所并不赞成的相对主义和怀疑论。
总的说来，皮尔士的科学方法不仅具有客观因素，其对独断论和怀疑论的批判与对进步和进化的强调，是对近代哲学思维方式的一种超越。
这既是他作为一个杰出的科学家对当时自然科学中所实际运用的认识方法的总结和概括，也是他作为一个敏锐的哲学家对西方哲学的现代转型所做的一定揭示。
但是他的理论存在很大的局限性。
例如，他对现实、实在的理解，没有超越当时已相当盛行的实证主义的现象主义的范围。
尽管如此，皮尔士的理论对杜威等后起的哲学家进一步实现西方哲学的现代转型仍然提供了重要的启示。
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