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现代西方哲学则主要是把哲学和科学对立起来，或者认为哲学是科学的逻辑（科学主义思潮），或者认为哲学是科学无法解决的人学（人本主义思潮）。
马克思主义哲学则从思维和存在的关系问题出发去理解哲学与科学的关系。
人类对于世界的认识，是由人类在其前进的发展中所创建的全部科学共同实现的。
任何一门科学，都把思维与存在的统一当作“理论思维的不自觉的和无条件的前提”
，而去致力于从各种不同的领域、各个不同的角度去揭示世界的运动规律。
与此相反，哲学在自身的历史发展过程中，则愈来愈自觉地把思维和存在的关系问题当作自己的基本问题，专门研究理论思维的这个“不自觉的和无条件的前提”
。
这样，作为科学形态的哲学，它所研究的就既不是独立于思维之外的存在（像古代哲学那样），也不是脱离开存在的思维（像近代哲学那样），而是从总体上把整个世界（自然的、社会的和精神的世界）作为思维的对立面，专门研究思维与存在的对立统一关系，揭示思维自觉反映存在运动的规律。
哲学以全部科学共同的根本矛盾——思维和存在的关系问题——作为自己的基本问题，这就不仅把哲学与实证科学确切地区别开来，而且真正把二者内在地统一起来。
思维和存在的关系问题作为哲学的基本问题，它就不是哲学中的“一个”
问题（无论把“这个问题”
说得多么重要），而是对全部哲学问题的本质抽象（正如把全部数学问题都抽象为数量关系和空间形式问题一样），一切问题只有提升到思维和存在的关系问题，它才是哲学问题；否则，就是实证科学问题。
同时，由于思维自觉反映存在运动的规律，就体现在人类思维的历史过程中，特别是集中地体现在人类认识世界所获得的科学成果以及获得这些成果的理论活动之中，所以，哲学又必须以实证科学为基础，通过对实证科学的概括和总结来实现自身的发展。
这样，哲学才能凝聚着、积淀着人类在其前进的发展中所创建的全部科学反映世界的认识成果，科学地而不是幻想地展现出思维反映存在运动的规律，也就是思维和存在所服从的同一规律。
哲学与实证科学的这种对立统一关系表明，哲学的对象和性质取决于相互联系的两个方面：一是对实证科学依赖的深刻性，二是对哲学基本问题解决的自觉性。
当科学尚在哲学母体的怀抱中，哲学基本问题还处在朦胧状态的时候，哲学必然以“整个世界”
为对象，具有“知识总汇”
的性质；当科学成长起来，纷纷从哲学母体中独立出去，哲学基本问题处于明朗状态的时候，哲学必然转向对人类认识的反省，以“人类意识”
为对象，试图为科学提供认识的根据，从而具有“科学的科学”
的性质；只有当哲学既完全地、彻底地依赖于实证科学，又自觉地、科学地解决哲学基本问题的时候，哲学才能成为哲学科学，才能科学地解决自己的对象问题。
哲学要完全地、彻底地依赖于实证科学，其前提是实证科学自身必须发达到足以揭示世界普遍联系的程度。
从19世纪初开始，自然科学已由主要是“收集材料”
的科学和关于既成事物的科学，发展为“整理材料”
的科学和关于过程、关于这些事物的发生和发展以及关于这些自然过程结合为一个伟大整体的联系的科学。
恩格斯说，由于细胞学说、能量守恒和转化定律、达尔文生物进化论这三大发现和自然科学的其他巨大进步，“我们现在不仅能够说明自然界中各个领域内的过程之间的联系，而且总的说来也能说明各个领域之间的联系了，这样，我们就能够依靠经验自然科学本身所提供的事实，以近乎系统的形式描绘出一幅自然界联系的清晰图画”
[10]。
在这种科学背景下，那种“用观念的、幻想的联系来代替尚未知道的现实的联系”
的“自然哲学就最终被排除了。
任何使它复活的企图不仅是多余的，而且是倒退”
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