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这种情况，在天体物理、生命的起源和本质、思维的模拟等领域中，就表现得相当明显而尖锐。
越是在这样的情况下，自然科学越是要自觉地接受辩证唯物主义世界观的指导。
单靠自发的唯物主义和辩证法是摆脱不了唯心主义和形而上学的束缚和干扰的。
正如列宁所指出的，任何自然科学，“如果没有充分可靠的哲学论据，是无法对资产阶级思想的侵袭和资产阶级世界观的复辟坚持斗争的。
为了坚持这个斗争，为了把它进行到底并取得完全胜利，自然科学家就应该做一个现代的唯物主义者，做一个以马克思为代表的唯物主义的自觉拥护者，也就是说应当做一个辩证唯物主义者。”
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要坚持哲学对具体科学的正确指导，就必须批判歪曲哲学和具体科学相互关系的种种错误观点。
现代西方哲学中有许多流派公开把哲学看成是凌驾于自然科学之上的东西。
例如现象学就认为，自然科学是一种低级知识，是包含错误的相对知识，而哲学则是一种高级知识，并只有现象学才配称这样的哲学。
现象学的创始人胡塞尔认为，只有追求“永久性哲学理想”
的现象学才是“严格的科学”
，其他的哲学，首先是唯物主义哲学，经验自然科学，都不是严格的科学，不是真正的科学。
因此，哲学不能以自然科学为依据，自然科学无权干预和批评哲学；相反，自然科学却应以哲学为基础，哲学是驱使人们“超越其特殊的周围世界而朝向无限世界的内心冲动”
。
这种主张，显然是十分荒唐的。
这种“严格科学”
宣扬“现象学就是对意识的研究”
，必须抛弃对“事实存在”
的关切而去分析意识本身，只有在主观意识中才有绝对的客观性。
这样，它就既不严格更不科学，而是彻头彻尾反科学的主观唯心主义。
这样颠倒哲学和科学的关系，既是为着抗拒自然科学对唯心主义的打击，又会把自然科学的发展引向唯心主义的邪路。
再如新托马斯主义的最主要代表马利坦认为，哲学“有权对每一门其他科学作出判断，把与它自己的结论相抵触的任何科学假设都斥之为错误”
。
这实际上就意味着要科学服从神学。
可见，现象学、新托马斯主义等流派的出现是一种哲学上和科学上的倒退和反动。
类似这种开倒车的行为，我国在“四人帮”
横行期间也表现得特别猖狂。
“四人帮”
抛出过一个臭名昭著的“代替论”
，鼓吹“马克思主义哲学”
、“自然辩证法”
就是自然科学的基础理论。
因此，哲学就可以包罗、包办、代替自然科学的研究。
在这种“代替论”
盛行之时，哲学套语、政治口号成了判断科学是非的最高标准；大话、空话、假话代替了资料积累、刻苦研究和科学实验。
在所谓“马克思主义哲学指导作用”
的旗号下，唯心主义横行，形而上学猖獗，使我国的科学事业遭受了一场空前的浩劫。
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